Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms