Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fundc1Q9DB70 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms