Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms