Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam3aQ9D8T0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam3aQ9D8T0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms