Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl17Q9D8P4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms