Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Chp2Q9D869 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Chp2Q9D869 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Chp2Q9D869 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Chp2Q9D869 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Chp2Q9D869 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Chp2Q9D869 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Chp2Q9D869 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Chp2Q9D869 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms