Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp4cQ9D7F7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms