Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srp19Q9D7A6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srp19Q9D7A6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srp19Q9D7A6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Srp19Q9D7A6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srp19Q9D7A6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Srp19Q9D7A6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Srp19Q9D7A6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srp19Q9D7A6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srp19Q9D7A6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srp19Q9D7A6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Srp19Q9D7A6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Srp19Q9D7A6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Srp19Q9D7A6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Srp19Q9D7A6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Srp19Q9D7A6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Srp19Q9D7A6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Srp19Q9D7A6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srp19Q9D7A6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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