Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms