Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
4933428G20RikQ9D3X4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms