Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms