Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms