Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms