Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps28Q9D1C8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps28Q9D1C8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms