Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl28Q9D1B9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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