Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ddx56Q9D0R4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ddx56Q9D0R4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ddx56Q9D0R4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ddx56Q9D0R4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ddx56Q9D0R4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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