Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nde1Q9CZA6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nde1Q9CZA6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nde1Q9CZA6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nde1Q9CZA6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nde1Q9CZA6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nde1Q9CZA6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nde1Q9CZA6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nde1Q9CZA6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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