Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl55Q9CZ83 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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