Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms