Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bud23Q9CY21 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Bud23Q9CY21 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Bud23Q9CY21 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Bud23Q9CY21 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Bud23Q9CY21 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bud23Q9CY21 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Bud23Q9CY21 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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