Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx7Q9CY18 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx7Q9CY18 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx7Q9CY18 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx7Q9CY18 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx7Q9CY18 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms