Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp23Q9CX11 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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