Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms