Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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