Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrpb2Q9CQI7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms