Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms