Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQ90 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms