Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms