Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brms1Q99N20 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms