Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ms4a4dQ99N05 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ms4a4dQ99N05 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ms4a4dQ99N05 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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