Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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