Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RtcbQ99LF4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RtcbQ99LF4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RtcbQ99LF4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RtcbQ99LF4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RtcbQ99LF4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RtcbQ99LF4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RtcbQ99LF4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms