Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Reep3Q99KK1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms