Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Apobec3Q99J72 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Apobec3Q99J72 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Apobec3Q99J72 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Apobec3Q99J72 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Apobec3Q99J72 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Apobec3Q99J72 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Apobec3Q99J72 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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