Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Derl1Q99J56 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms