Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Sfxn4Q925N1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sfxn4Q925N1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sfxn4Q925N1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sfxn4Q925N1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sfxn4Q925N1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sfxn4Q925N1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sfxn4Q925N1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sfxn4Q925N1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Sfxn4Q925N1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sfxn4Q925N1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms