Protein–RNA interactions for Protein: Q925F4

Ubox5, RING finger protein 37, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubox5Q925F4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ubox5Q925F4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubox5Q925F4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubox5Q925F4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubox5Q925F4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ubox5Q925F4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ubox5Q925F4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ubox5Q925F4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubox5Q925F4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ubox5Q925F4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms