Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms