Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trim59Q922Y2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms