Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms