Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttc39cQ8VE09 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttc39cQ8VE09 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39cQ8VE09 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ttc39cQ8VE09 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
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Ttc39cQ8VE09 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Ttc39cQ8VE09 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Ttc39cQ8VE09 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ttc39cQ8VE09 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ttc39cQ8VE09 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ttc39cQ8VE09 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ttc39cQ8VE09 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ttc39cQ8VE09 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ttc39cQ8VE09 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39cQ8VE09 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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