Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Stx18Q8VDS8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms