Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Slc6a20aQ8VDB9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Slc6a20aQ8VDB9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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