Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms