Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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