Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dnaaf4Q8R368 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf4Q8R368 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms