Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms