Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl47Q8K2Y7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms