Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms