Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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